Сельскохозяйственная геномика, или агрогеномика, возникла и развивается прежде всего благодаря достижениям вычислительной биологии, биотехнологии растений и высокопроизводительным омиксным технологиям.
Агрогеномика меняет традиционные стратегии селекции сельскохозяйственных культур, ускоряет процесс создания новых сортов, способных противостоять болезням и вредителям растений, изменениям климата и вызовам, связанным с ростом населения планеты.
Наша работа сосредоточена на выявлении генетических маркеров, связанных с желательными признаками, для их дальнейшего использования в селекционной работе. Кроме того, мы разрабатываем новые вычислительные инструменты для реконструкции истории одомашнивания вида, определения и аннотации мутаций, накопленных культивируемыми сортами, выявления участков генома, связанных с ответом на селекцию, и определения аллелей, обеспечивающих адаптацию растений к условиям окружающей среды.
Эта работа ведется в сотрудничестве с Университетом Тайваня, университетами Южной Калифорнии и штата Вермонт (США), а также Российским институтом генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова (ВИР), Санкт-Петербург.
Нас особенно интересуют бобовые культуры (такие как, например, нут и соя), однако мы также участвуем в проектах, связанных с другими полезными культурами (люцерна).
Лаборатория «Математическая биология и биоинформатика»
Адрес: 29АФ, помещения А.3.28 ‒ А.3.31, Политехническая улица, Санкт-Петербург, 195251 Россия
Телефон:
E-mail:
compbio@pm.me