Курс включает 16 академических часов, в том числе 4 часа аудиторных занятий и 12 часов практических занятий.
Режим занятий:
4‒8 часов в день, в течение 2-4 дней.
Лекции проводятся в специализированной аудитории Научно-исследовательского комплекса СПбПУ (ауд. А3.30). Практические занятия проводятся в лабораторном помещении Научно-исследовательского комплекса СПбПУ (ауд. Г3.27)
Стоимость обучения зависит от размера группы.
После успешного прохождения программы слушателем выдается свидетельство государственного образца.
Слушатели должны обладать базовыми знаниями по статистике и генетике.
Быстрое развитие прикладных геномных исследований предоставляет эффективный инструмент для повышения эффективности селекции растений, путём маркерной селекции. Важными компонентом этой технологий является поиск молекулярных маркеров, тесно связанных с целевыми генами, для чего часто используют полногеномный поиск ассоциаций. В последнее время полногеномный поиск ассоциаций начинает использоваться в современных программах селекции. Разработаны пакеты программ с удобными интерфейсами, не требующими спeциальной программисткой подготовки. Однако, несмотря на кажущуюся простоту, в применении полногеномного поиска ассоциаций есть много подводных камней. Важно уметь правильно подготовить данные для анализа, оценить их достаточность для получения достоверных результатов, учесть все факторы, потенциально могущие повлиять на точность анализа. Наш курс позволит в течение короткого времени понять, как избежать ошибок при проведении полногеномного поиска ассоциаций, а также практически освоить наиболее часто используемые пакеты программ, в которых этот метод реализован.
Курс состоит из вводной теоретической части, где участники знакомятся с теоретическими основами метода, с особенностью его применения и ограничениями. Здесь же дается обзор имеющихся пакетов программ с разбором реализованных в них алгоритмов и с практическими примерами применения, причем особое внимание уделяется возможности использования пакетов в среде Windows. Практическая часть включает обучение работе с пакетами программ Tassel и GAPIT:
Профессор высшей школы прикладной математики и вычислительной физики, заведующий НИЛ «Математическая биология и биоинформатика» ФГАОУ ВО «СПбПУ»
Доцент СПбГУ, ведущий научный сотрудник НИЛ «Математическая биология и биоинформатика» ФГАОУ ВО «СПбПУ»
По вопросам о программе и для записи на программу пишите по адресу osyaginae@mail.ru
Молекулярные маркеры в селекции растений:...