19 сентября в 11.00 в лаборатории математической биологии и биоинформатики состоится презентация доклада Афонникова Дмитрия Аркадьевича (к.б.н., в.н.с. ИЦиГ СО РАН, г. Новосибирск).

Тема доклада: «Компьютерные методы высокопроизводительного фенотипирования растений» представление диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук по специальности 1.5.8. – математическая биология, биоинформатика.

Аннотация: Разработана экспериментально-компьютерная платформа ICGPhenoPlant для высокопроизводительного фенотипирования растений на основе анализа цифровых изображений и изучение с ее помощью взаимосвязи признаков фенотипа растений с генотипом и ответом на воздействие окружающей среды. Платформа включает приложения: LHDetect2 для оценки количественных характеристик опушения листьев пшеницы, картофеля и табака; SeedСounter для оценки признаков размера, формы и цвета оболочки зерен пшеницы; WERecognizer для оценки характеристик размера и формы колоса пшеницы. Разработаны базы данных WheatPGE и SpikeDroid для хранения данных о фенотипе, генотипе и месте произрастания растений пшеницы в процессе селекционно-генетического эксперимента. Разработанная система позволила провести анализ связи фенотипа и генотипа для признаков опушения листьев пшеницы, признаков зерен пшеницы в популяции ITMI, разработать описание характеристик колосьев пшеницы в базе данных SpikeDroid.